MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011984	AAAGC	2	10	37742	37751	60 %	0 %	20 %	20 %	222083178
502	NC_011984	GC	4	8	37767	37774	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
503	NC_011984	AACG	2	8	37808	37815	50 %	0 %	25 %	25 %	222083178
504	NC_011984	CCA	2	6	37888	37893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083178
505	NC_011984	GAC	2	6	38017	38022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
506	NC_011984	TGT	2	6	38030	38035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083178
507	NC_011984	CGG	2	6	38200	38205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
508	NC_011984	CTGGC	2	10	38209	38218	0 %	20 %	40 %	40 %	222083178
509	NC_011984	CGA	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
510	NC_011984	GCG	2	6	38280	38285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
511	NC_011984	GGC	3	9	38325	38333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
512	NC_011984	AAC	2	6	38339	38344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083178
513	NC_011984	GGA	2	6	38380	38385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
514	NC_011984	AGC	2	6	38425	38430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
515	NC_011984	ATTC	2	8	38441	38448	25 %	50 %	0 %	25 %	222083178
516	NC_011984	CTG	2	6	38461	38466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
517	NC_011984	GCC	2	6	38484	38489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
518	NC_011984	GC	3	6	38624	38629	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
519	NC_011984	GCT	2	6	38632	38637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
520	NC_011984	CTG	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
521	NC_011984	AGC	2	6	38741	38746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
522	NC_011984	GCA	2	6	38829	38834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
523	NC_011984	CGC	2	6	38898	38903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
524	NC_011984	GCC	2	6	38944	38949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
525	NC_011984	AGG	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
526	NC_011984	CGA	2	6	39060	39065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
527	NC_011984	GCC	2	6	39109	39114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083178
528	NC_011984	TCCT	2	8	39127	39134	0 %	50 %	0 %	50 %	222083178
529	NC_011984	AGA	2	6	39170	39175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083178
530	NC_011984	CTT	2	6	39330	39335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083178
531	NC_011984	TCCT	2	8	39359	39366	0 %	50 %	0 %	50 %	222083178
532	NC_011984	ATCG	2	8	39403	39410	25 %	25 %	25 %	25 %	222083178
533	NC_011984	GT	3	6	39419	39424	0 %	50 %	50 %	0 %	222083178
534	NC_011984	TTC	2	6	39454	39459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083178
535	NC_011984	GAC	2	6	39474	39479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
536	NC_011984	GGA	2	6	39524	39529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083178
537	NC_011984	ATC	2	6	39532	39537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083178
538	NC_011984	CTG	2	6	39589	39594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083178
539	NC_011984	GCA	3	9	39702	39710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
540	NC_011984	GGC	2	6	39738	39743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
541	NC_011984	ATCG	2	8	39915	39922	25 %	25 %	25 %	25 %	222083179
542	NC_011984	CAG	2	6	39970	39975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083179
543	NC_011984	GATCT	2	10	39986	39995	20 %	40 %	20 %	20 %	222083179
544	NC_011984	AGT	2	6	40014	40019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083179
545	NC_011984	GACG	2	8	40041	40048	25 %	0 %	50 %	25 %	222083179
546	NC_011984	CGG	2	6	40054	40059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
547	NC_011984	CAG	2	6	40129	40134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083179
548	NC_011984	CAT	2	6	40191	40196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083179
549	NC_011984	GGC	2	6	40256	40261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
550	NC_011984	TC	3	6	40287	40292	0 %	50 %	0 %	50 %	222083179
551	NC_011984	TC	3	6	40340	40345	0 %	50 %	0 %	50 %	222083179
552	NC_011984	CGG	2	6	40445	40450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
553	NC_011984	GCT	2	6	40504	40509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083179
554	NC_011984	TCC	2	6	40510	40515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083179
555	NC_011984	GAC	2	6	40762	40767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083180
556	NC_011984	GCG	2	6	40775	40780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083180
557	NC_011984	TGC	2	6	40968	40973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
558	NC_011984	GCA	2	6	40992	40997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083181
559	NC_011984	GCC	2	6	41109	41114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083181
560	NC_011984	GTC	2	6	41121	41126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
561	NC_011984	TGC	2	6	41194	41199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083181
562	NC_011984	TTC	2	6	41200	41205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083181
563	NC_011984	GAC	2	6	41285	41290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083181
564	NC_011984	ACA	2	6	42202	42207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083182
565	NC_011984	CGA	2	6	42267	42272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083182
566	NC_011984	CG	4	8	42298	42305	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
567	NC_011984	GAT	2	6	42370	42375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083182
568	NC_011984	GC	3	6	42497	42502	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
569	NC_011984	TGC	2	6	42541	42546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
570	NC_011984	GAGG	2	8	42559	42566	25 %	0 %	75 %	0 %	222083182
571	NC_011984	CTG	2	6	42571	42576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
572	NC_011984	GTC	2	6	42595	42600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
573	NC_011984	CAC	2	6	42624	42629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083182
574	NC_011984	GCGT	2	8	42638	42645	0 %	25 %	50 %	25 %	222083182
575	NC_011984	CGAC	2	8	42654	42661	25 %	0 %	25 %	50 %	222083182
576	NC_011984	CCG	2	6	42687	42692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083182
577	NC_011984	GCT	2	6	42827	42832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
578	NC_011984	GC	3	6	42873	42878	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
579	NC_011984	TGC	2	6	42886	42891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083182
580	NC_011984	TCC	2	6	42896	42901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083182
581	NC_011984	CTT	2	6	42907	42912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083182
582	NC_011984	TTC	2	6	42972	42977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083182
583	NC_011984	CG	3	6	42991	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	222083182
584	NC_011984	ATG	2	6	43146	43151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083182
585	NC_011984	CTGG	2	8	43153	43160	0 %	25 %	50 %	25 %	222083182
586	NC_011984	GAC	2	6	43538	43543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083182
587	NC_011984	CGG	2	6	44003	44008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083183
588	NC_011984	CAA	2	6	44065	44070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083183
589	NC_011984	TTC	2	6	44165	44170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083183
590	NC_011984	GTG	2	6	44228	44233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083183
591	NC_011984	CGC	2	6	44234	44239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083183
592	NC_011984	CTTGGC	2	12	44406	44417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083184
593	NC_011984	CGC	2	6	44435	44440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083184
594	NC_011984	AAG	2	6	44486	44491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083184
595	NC_011984	AGCA	2	8	44587	44594	50 %	0 %	25 %	25 %	222083184
596	NC_011984	CAAA	2	8	44645	44652	75 %	0 %	0 %	25 %	222083184
597	NC_011984	TCC	2	6	44658	44663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083184
598	NC_011984	TCG	2	6	44665	44670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083184
599	NC_011984	CGC	2	6	44675	44680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083184
600	NC_011984	GTTT	2	8	45018	45025	0 %	75 %	25 %	0 %	222083185
601	NC_011984	GCG	2	6	45240	45245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083185
602	NC_011984	GTT	2	6	45320	45325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083185
603	NC_011984	CGG	2	6	45334	45339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083185
604	NC_011984	GCC	2	6	45351	45356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
605	NC_011984	GTT	2	6	45357	45362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083185
606	NC_011984	CAG	2	6	45366	45371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
607	NC_011984	CAG	2	6	45374	45379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
608	NC_011984	TGC	2	6	45435	45440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083185
609	NC_011984	GGA	2	6	45460	45465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083185
610	NC_011984	CGA	2	6	45505	45510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083185
611	NC_011984	TCC	2	6	45540	45545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083185
612	NC_011984	GCC	2	6	45710	45715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
613	NC_011984	ACA	2	6	45750	45755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083185
614	NC_011984	CCG	2	6	45822	45827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083185
615	NC_011984	ATC	2	6	45905	45910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083185
616	NC_011984	CGAAA	2	10	45925	45934	60 %	0 %	20 %	20 %	222083185
617	NC_011984	GCG	2	6	46669	46674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083186
618	NC_011984	CGA	2	6	46679	46684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083186
619	NC_011984	GGA	2	6	46686	46691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083186
620	NC_011984	TCT	2	6	46706	46711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083186
621	NC_011984	TTGC	2	8	46754	46761	0 %	50 %	25 %	25 %	222083186
622	NC_011984	CTT	2	6	46858	46863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083186
623	NC_011984	GGC	2	6	46908	46913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083186
624	NC_011984	GCCAAG	2	12	46932	46943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083186
625	NC_011984	GCG	2	6	47110	47115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083187
626	NC_011984	CAC	2	6	47116	47121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083187
627	NC_011984	GAA	2	6	47179	47184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083187
628	NC_011984	TTG	2	6	47279	47284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083187
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750	NC_011984	GCG	2	6	56525	56530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083194
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782	NC_011984	CGG	2	6	58684	58689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083195
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786	NC_011984	CG	3	6	58889	58894	0 %	0 %	50 %	50 %	222083195
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999	NC_011984	CG	3	6	74684	74689	0 %	0 %	50 %	50 %	222083205
1000	NC_011984	GAT	2	6	74734	74739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083205

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